新亞特蘭蒂斯在三大物流巨頭中不僅歷史最為悠久，而且擁有數量最為龐大的船隊，掌控著全球大部分的海上貿易航線。他們在「終焉之戰」後把殘存下來的軍用及商用船隻重新組編成運力強大的船隊，又將巨大的軍艦及貨輪改造並組成人工群島，發展成為巨大的海上貿易樞紐——亞特蘭蒂斯，並在之上建立總部。 能夠在海盜橫行的海域長期保持強勢，不僅仰仗船隊中的軍艦，更關鍵在於新亞特蘭蒂斯擁有破壞力強大的波塞冬海上移動堡壘，它們遊弋在航線之間令各方勢力忌憚。 在他們的貿易貨物中，價值最高的除了能源，還有讓人垂涎三尺的高新科技，近水樓台令新亞特蘭蒂斯的科技裝備水平始終走在酸雨時代的前端。